2009年3月、生活対策に基づく高速道路料金の引き下げ開始と同時に、各種時間帯割引が本格的に開始された。まず、3月20日から休日特別割引（上限1,000円）がアクアラインで先行実施され、3月28日には深夜割引・通勤割引、3月30日には平日夜間割引・平日昼間割引も開始された。2009年千葉県知事選挙で、森田健作がETC無線走行に限り普通車800円へ引き下げると公約し当選した。これにより、内閣総理大臣麻生太郎と会談が行われ、麻生政権下の国土交通省（日本国政府）と千葉県が必要費用を負担する社会実験として、2009年8月1日から通行料金を毎日終日800円（普通車）へ大幅に引き下げた。当初予定は2011年（平成23年）3月31日までであったが、さらに延長された。
整備重視の料金から利用重視の料金への転換という方針のもと、伊勢湾岸道路と同等の108.1円/kmに料金水準が引き下げられた。ただし、債務の返済状況やETC車の割合が増え料金徴収コスト差が拡大している現状を考慮し、ETC限定で当面10年間実施とされた。
ETC普通車800円は、消費税率が8%となる2014年度以降も、千葉県が引き続き費用の一部を負担することを前提としてそのままの額で継続されることになり、財源は平成25年度補正予算により手当された。
割引期間は10年間という報道もあるが、NEXCOのプレスリリースでは「当分の間」、事業許可においては「東日本高速道路株式会社が別に定める日まで」されている。千葉県も補助を継続する方針で、2015年度千葉県当初予算案で、東京湾アクアライン料金割引事業として5億円が計上されている。
