世界遺産地域は、中央部の核心地域と周辺の緩衝地域に分かれ、これらの地域は世界遺産登録時より開発を行わず、現状のまま保護されることになっている。これらの地域には遺産登録以前からあった登山道以外には道はなく、今後も恒久的に整備されない。特に核心地域には道らしい道はない。青森県側の核心地域に入るには、当日までに森林管理署長に報告をする。秋田県側の核心地区は原則的に入山禁止。核心地区は林道すらないので、そこを踏破するには極めて高度な技術を必要とする。世界遺産に登録されてから、核心地区での遭難事故もあり死亡者も出ている。
世界遺産登録地域は、登録前後に禁猟区に指定されている。漁を行うには漁業協同組合と森林管理署長の許可が必要である。漁業組合はここを通年禁漁としている。自然の資源を必要なだけ利用してきたマタギによる狩猟も禁止されたことから、禁猟によりマタギ文化が消失するという批判も存在する。自然保護のために、核心地域への立ち入りを全面的に禁止すべきかどうか、かつてのマタギなどのように、そこで生活の糧を得ていた人たちまで規制する必要があるのかどうか、議論はかみあっていない。
白神山地の位置は、青森県西津軽郡鰺ヶ沢町、深浦町、中津軽郡西目屋村、秋田県山本郡藤里町で標高300m - 1243mの向白神岳に及ぶ山岳地帯である。(N 40°22' - 32'、E 140°2' - 12')